Välibaasid
Eesti mereinstituudi kasutada on kuus välibaasi (Pärnu, Praaga, Matsalu, Kihnu, Käsmu, Kõiguste). Välibaase kasutatakse eelkõige välitööde (riiklik seire, rahvusvahelised projektid) läbiviimiseks. Lisaks eelmainitule toimub välibaasides hulgaliselt õppetöödega seonduvaid praktikume ja eelkõige teadusalaseid seminare.
Välibaase võivad kasutada lisaks Ülikooli erinevatele struktuuridele ka väljaspoolt tulevad huvilised.