Eesti mereinstituudi laborid omavad maailmatasemel aparatuuri ja kompetentsi teostamaks parima kvaliteediga mereuuringuteks vajalikke analüüse.
Tartu Ülikooli Eesti mereinstituudi laborid on Eesti Akrediteerimiskeskuse poolt akrediteeritud katselaborid, omades akrediteerimistunnistust numbriga L179 (standard EVS-EN ISO/IEC 17025:2017).
Mereinstituudi laborite akrediteerimisulatusega saab tutvuda akrediteerimistunnistuse lisas (Lisa L179), kus on kirjas teostatavad analüüsimeetodid.
Laborid osalevad regulaarselt rahvusvahelistes võrdluskatsetes ja interkalibreerimistel.
Laborid kuuluvad EAK perioodilise järelevalve alla.
Esmakordne TÜ Eesti mereinstituudi laborite akrediteerimine toimus 9. septembril 2008. Laborid on Eesti esimesed merevaldkonnas EAK poolt kompetentseks tunnistatud katselaborid, mis viivad läbi veekeemia ja merebioloogia analüüse vastavalt standardile EVS-EN ISO/IEC 17025:2017 „Katse- ja kalibreerimislaborite kompetentsuse üldnõuded“.
Laborite akrediteeritus on vajalik analüüside teostamiseks riikliku keskkonnaseire raames, mida sätestavad Eesti Vabariigis mitmed õigusaktid (Veeseadus, Keskkonnaseire seadus). Kvaliteedi tagamise ja kontrolli vajalikkust mereseires soovitavad ka mitmed rahvusvahelised mereuurimise alased kokkulepped (HELCOM COMBINE, ICES). Kõiki laborite katsemeetodeid rakendatakse Eesti rannikumere keskkonnaseires, seda ka selleks, et tagada võrreldavus teiste riikide mereseire programmidega.