Meri ja sellega seotud tegevused, sealhulgas laevandus, kalandus, turism ja energiasektor, on väga olulisel kohal Eesti majanduses tervikuna, samuti regionaalses arengus ning kultuuris. Tartu Ülikooli Eesti mereinstituut pakub alusteaduslikku teavet Läänemere keskkonna pikaajalisel säästliku kasutamise korraldamisel ning panustab merealade ruumilisse planeerimisse. Uurimisvaldkondade laia spektriga kaetakse teemad merefüüsikast bioloogia ja optikani, omades enamustes valdkondades Eesti jaoks unikaalset kvalifikatsiooni.