Eesti mereinstituudi raamatukogu on Eesti parim merevaldkonna teoseid omav raamatukogu, mis püüab võimalikult täiuslikult komplekteerida Eesti siseveekogusid ja Läänemerd hõlmavaid publikatsioone.
Osakonnas tegeletakse kalavaruse seirega, aga ka hüljeste ja kalanduse konfliktide analüüsi, koelmute uuringute, püügivahendite selektiivsuse tõstmise võimaluste analüüsiga jne.
Meri ja sellega seotud tegevused, sealhulgas laevandus, kalandus, turism ja energiasektor, on väga olulisel kohal Eesti majanduses tervikuna, samuti regionaalses arengus ning kultuuris.